انتشارات

ماهنامه فناوری‌های همگرا

شماره ۹

مهر 1395

آرشیو ماهنامه
رویدادها
    آرشیو رویداد ها

    محورهای فراخوان

    زنجیره ارزش داده‌های نسل جدید توالی‌یابی (NGS) شامل 4 بخش تولید داده، پایگاه داده، تحلیل داده و مشتری است. بخش تولید داده، شامل همه فرایندها و ابزار دخیل در تولید داده است.

    پایگاه داده شامل زیرساخت‏‌ها و فرایندهای مربوط به ذخیره‏‌سازی داده‌ها است. بخش تحلیل داده شامل فرایندهای تحلیل و تفسیر داده‌ها و ارائه‏ گزارش‌‏های مفید است. در این بخش‌ شرکت‏‌های تحلیل داده به مشتریان خدمت ارائه می‌دهند.

    بر همین اساس با توجه به روندهای کنونی جهانی و همچنین وضعیت کشور در این حوزه، محورهای زیر اعلام می‌شود:

     

    در بخش تولید داده، کیت‌های مصرفی یکی از اجزاء بسیار ضروری هستند که آزمایشگاه‌های دارای دستگاه‌های تولید داده به آن‌ها نیاز دارند. این کیت‏‏‌ها بر اساس نوع دستگاه تولید داده (نوع‌برند) با هم تفاوت دارند. در همین راستا کیت‌های زیر برای دستگاه‏‌های دو برند معتبر ایلومینا (Illumina) و آیون تورنت (ION Torrent) مورد نظر است:

     

    * NIPT Kits (cell free DNA isolation, library preparation, enrichment and sequencing)

    * Exome Sequencing

    * DNA-Seq (Whole Genome) Sequencing

    * Target Capture Gene Panels

    * ChIP-Seq

    * RNA Sequencing (mRNA or cDNA sequencing)

    * Metagenomics Sequencing

    نرم افزارهای ذخیره، تحلیل و تفسیر داده

    این نرم‌‏افزارها در ذخیره‌‏سازی، همگام‌‏سازی، تحلیل و تفسیر داده‌ها و یا هوشمند‌سازی این کارها استفاده می‌‏شوند و مشتریان آن‏‌ها می‌‏تواند مراکز تحقیقاتی، آزمایشگاه‌های بالینی، مراکز درمانی، پایگاه‏‏‌های داده و شرکت‏‌ها باشد. بر همین اساس در این محور نرم‌افرهای زیر مورد نظر است:

    * شبکه‌سازی بین مراکزداده و بهره‌برداران (طرح های توزیع شبکه ای داده (ارتباط بین سرور های محلی،  اصلی، پشتیبان و معین ))

    * همسان‌سازی داده‌ها‌ی خروجی از پلتفرم‌های مختلف (WGS، WES، Transcriptome و ...)

    * فشرده‌سازی حداکثری داده‌ها با بیشترین کارایی

    * تهیه پلتفرم‌های نرم‌افزاری به منظور تعریف سطوح دسترسی مختلف مراکز داده و بهره‌برداران

    * هوشمندسازی پایگاه داده جهت پایش اطلاعات ورودی و خروجی و همچنین حفظ مالکیت صاحبان داده

    * نرم‏‏‌افزارهای تحلیل و تفسیر داده

     

     

    طرح‌‏های حوزه تحلیل داده:

    کسب‌وکارهای این حوزه متشکل از تیم‌های دارای تخصص‌های مکمل (مانند رشته‌های ژنتیک و کامپیوتر) است که با تحلیل و تفسیر داده‌های ژنومی می‏‌توانند در پیش‏‌بینی، پیشگیری، بهبود و درمان بیماری‌ها، فارماکوژنتیک، پزشکی فرد‌محور و همچنین تغذیه و رفاه فرد‌محور به مشتریان خدمت ارائه دهند. این خدمت می‏‌تواند به طور مستقیم به مردم یا به پزشکان و آزمایشگاه‏‌ها ارائه شود. این نوع کسب‌‏وکارها عموما دارای پایپلاین‌های نرم‌افزاری و پایگاه داده مناسب برای ارائه خدمت هستند، همچنین ممکن از از روش ‏های مبتنی بر هوش مصنوعی و یادگیری ماشین استفاده کنند.

     

     

    مقاله مرتبط با محورهای فراخوان
    • توالی‌یابی DNA به کمک نانوحفره‌ها

      نانوحفره‌ها به عنوان یک فناوری منحصر به فرد در توالی‌یابی DNA مطالعه شده‌اند و می‌توانند توالی قطعات بلند DNA را در کوتاه‌ترین زمان بخوانند. یک مولکول DNA می‌تواند با سرعت یک میکروثانیه به ازای هر...

    • بررسی مدل کسب و کار شرکت 23andme

      با توسعه روش‌‏های نسل جدید توالی‏‌یابی، هزینه تعیین توالی ژنوم کاهش چشمگیری یافت. این کاهش هزینه منجر به تولید حجم انبوهی از داده‏‌های ژنومی شده است و پیش‌‏بینی می‏‌شود در سال‏‌های آتی نیز این روند...

    • توالی‌یابی جمعیت‌های انسانی و تهدیدات زیستی نوین

      رشد سریع دانش در زمینه‌هایی هم‌چون زیست‌فناوری، فناوری‌نانو و نوروفارماکولوژی نویدبخش مزایای فراوانی برای سلامت و رفاه جامعه بشری است. از سوی دیگر امکان استفاده از این علوم و فناوری‌های در حال...

    • داده‌های ژنومی به‌مثابه ذخایر نفتی

      در دنیای امروز داده ثروت عظیمی محسوب می‌شود، بسیاری از شرکت‌های برتر دنیا مانند آمازون، فیس‌بوک و گوگل چیزی جز داده در اختیار ندارند. اکونومیست در گزارشی در ماه می 2017 نوشت: «در قرن بیست‌ویک،...

    • نسل جدید توالی‌یابی

      نسل جدید توالی‌یابی (NGS)، به مجموعه فناوری‌هایی اطلاق می‌شود که می‌توانند حجم زیادی از DNA را در مدت زمانی کوتاه و با هزینه کم توالی‌یابی کنند. با گسترش و فراگیر شدن این فناوری، انقلاب عظیمی در...

    - حذف مقاله + افزودن مقاله

    اخبار مرتبط با محورهای فراخوان
    - حذف خبر + افزودن خبر